Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lonrf3Q9D4H7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lonrf3Q9D4H7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms