Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UvssaQ9D479 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
UvssaQ9D479 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UvssaQ9D479 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UvssaQ9D479 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms