Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933421I07RikQ9D420 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933421I07RikQ9D420 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933421I07RikQ9D420 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms