Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx29Q9D3S3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx29Q9D3S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms