Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D2Q3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D2Q3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms