Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SarnpQ9D1J3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SarnpQ9D1J3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms