Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm12Q9D0R8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm12Q9D0R8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsm12Q9D0R8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm12Q9D0R8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms