Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis18aQ9CZJ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis18aQ9CZJ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms