Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nde1Q9CZA6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nde1Q9CZA6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms