Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc3Q9CXE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc3Q9CXE6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms