Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp23Q9CX11 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp23Q9CX11 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Utp23Q9CX11 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp23Q9CX11 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp23Q9CX11 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp23Q9CX11 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp23Q9CX11 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms