Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atxn3Q9CVD2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atxn3Q9CVD2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn3Q9CVD2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms