Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930553M12RikQ9CUH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930553M12RikQ9CUH1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930553M12RikQ9CUH1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms