Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msmo1Q9CRA4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msmo1Q9CRA4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msmo1Q9CRA4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms