Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc96Q9CR92 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc96Q9CR92 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc96Q9CR92 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms