Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim8Q9CQQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim8Q9CQQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim8Q9CQQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim8Q9CQQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms