Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhbQ9CQA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SdhbQ9CQA3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhbQ9CQA3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms