Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQ90 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQ90 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQ90 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQ90 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQ90 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CQ90 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CQ90 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CQ90 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms