Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim11Q99PQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim11Q99PQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim11Q99PQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms