Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim3Q99PE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim3Q99PE5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim3Q99PE5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms