Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bco2Q99NF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bco2Q99NF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bco2Q99NF1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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