Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcam1Q99NB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcam1Q99NB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms