Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rnf17Q99MV7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rnf17Q99MV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rnf17Q99MV7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rnf17Q99MV7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rnf17Q99MV7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms