Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx50Q99MJ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx50Q99MJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx50Q99MJ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx50Q99MJ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms