Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SncaipQ99ME3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SncaipQ99ME3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms