Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins4Q99LZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gins4Q99LZ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins4Q99LZ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gins4Q99LZ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms