Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm3Q99LJ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cmtm3Q99LJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm3Q99LJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm3Q99LJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms