Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf2Q99LE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf2Q99LE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf2Q99LE6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms