Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TriobpQ99KW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TriobpQ99KW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TriobpQ99KW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TriobpQ99KW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms