Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nlgn1Q99K10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nlgn1Q99K10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nlgn1Q99K10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms