Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdcbp2Q99JZ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdcbp2Q99JZ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdcbp2Q99JZ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms