Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krcc1Q99JT5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krcc1Q99JT5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krcc1Q99JT5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms