Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnip2Q99JG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnip2Q99JG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnip2Q99JG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnip2Q99JG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms