Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pacsin3Q99JB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pacsin3Q99JB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms