Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ophn1Q99J31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ophn1Q99J31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ophn1Q99J31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms