Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms