Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdl1Q923A2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdl1Q923A2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spdl1Q923A2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spdl1Q923A2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms