Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Clip1Q922J3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Clip1Q922J3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Clip1Q922J3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Clip1Q922J3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms