Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tubb6Q922F4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb6Q922F4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb6Q922F4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms