Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lims2Q91XD2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lims2Q91XD2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lims2Q91XD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms