Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NifkQ91VE6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NifkQ91VE6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms