Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp4Q8VHC5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp4Q8VHC5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp4Q8VHC5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms