Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SelenomQ8VHC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenomQ8VHC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms