Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps4aQ8VEJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vps4aQ8VEJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vps4aQ8VEJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms