Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt79Q8VED5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt79Q8VED5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms