Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg8Q8VE18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg8Q8VE18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms