Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8VDP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8VDP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8VDP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q8VDP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8VDP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8VDP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8VDP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8VDP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8VDP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8VDP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8VDP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8VDP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q8VDP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8VDP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8VDP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms