Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc8Q8VD72 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc8Q8VD72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc8Q8VD72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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