Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med17Q8VCD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med17Q8VCD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med17Q8VCD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1096 ms