Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxnl1Q8VC33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxnl1Q8VC33 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms